Присоединяйся к нам
Платформа, где покупают и продают студенческие работы
Молекулярная биология, 70 вопросов

Молекулярная биология, 70 вопросов

Ответы на билеты, Естественнонаучные, Молекулярная биология, БГУ
61 страница
2018 год
21.0BYN
63.0BYN
Купить
Поделиться в социальных сетях
Содержание
Часть работы
Список литературы

1. Строение молекулы ДНК: химический состав мономерных звеньев молекулы ДНК, 5'-3' – фософодиэфирная связь, комплементарные пары оснований; связи, удерживающие между собой две полинуклеотидные цепи; стэкинг-взаимодействие.
2. Физико-химические свойства ДНК: денатурация и ренатурация молекулы, температура плавления, гиперхромный и гипохромный эффекты.
3. Характеристика В-формы двойной спирали ДНК и альтернативных двуспиральных структур ДНК, их биологическое значение.
4. Суперспирализация ДНК. Топологические проблемы, возникающие в ходе матричных процессов.
5. Топоизомеразы I и II типов, механизм их действия.
6. Нуклеосомное строение хроматина. Эухроматин и гетерохроматин. Репликация ДНК
7. Механизм реакции полимеризации ДНК и его катализ. Экзонуклеазные активности ДНК-полимераз и их роль в обеспечении точности воспроизведения ДНК.
8. Характеристика ДНК-полимерз E.coli: размеры, субъединичный состав, ферментативные активности и участие в процессах репликации и репарации.
9. Структура ДНК-полимеразы III E.coli, функции ее отдельных субъединиц. Модель работы димерной полимеразы; координация синтеза ДНК на комплементарных нитях.
10. Характеристика ДНК-полимераз эукариот: размеры, субъединичный состав, ферментативные активности и участие в процессах репликации и репарации.
11. Структура вилки репликации: события на ведущей и отстающей нитях. Полунепрерывный синтез и фрагменты Оказаки. Участие в репликации вспомогательных белков (SSB, хеликазы, праймазы, лигазы).
12. Регуляция инициации репликации у E.coli: структура участка старта репликации (OriC), участие белков DnaA, DnaB, DnaC и DnaG в процессе инициации.
13. Механизм репликации концов линейных хромосом эукариот с помощью теломеразы. Репарация и рекомбинация ДНК
14. Прямая репарация тиминовых димеров, алкилированных оснований и одноцепочечных разрывов в молекуле ДНК.
15. Репарация неправильно спаренных оснований с помощью комплекса белков MutLSH.
16. Эксцизионная репарация оснований.
17. Эксцизионная репарация нуклеотидов с помощью белков uvrABC.
18. SOS-репарация.
19. Рекомбинационная репарация.
20. Механизм общей (гомологичной) рекомбинации: образование гетеродуплексов, миграция ветви, разрешение структур Холлидея. Роль белков RecA, RecBCD и RuvABC в рекомбинации у E.coli.
21. Сайт-специфическая рекомбинация (механизм интеграция фага λ в бактериальную хромосому). Мобильные генетические элементы
22. Характеристика IS-элементов и транспозонов бактерий: структура и механизм перемещения.
23. Характеристика ДНК-транспозонов эукариот: структура, механизм перемещения, представители.
24. Ретротранспозоны с длинными концевыми повторами: структура, механизм перемещения, представители.
25. Ретротранспозоны без длинных концевых повторов: структура, механизм перемещения, представители. Транскрипция ДНК
26. Понятие о кодирующей и некодирующей (матричной) цепях ДНК. Единица транскрипции у про- и эукариот и ее структурные элементы.
27. Особенности структуры РНК-полимеразы E.coli: кор-фермент и холофермент, роль отдельных субъединиц.
28. Альтернативные σ-факторы и их роль в инициации транскрипции.
29. Характеристика РНК-полимераз I, II и III эукариот: структура и синтезируемые ими молекулы.
30. Структура бактериального промотора и механизм его распознавания РНК-полимеразой. Инициация транскрипции у прокариот. Стадии транскрипционного цикла.
31. Завершение транскрипции у прокариот: Rho-зависимые и независимые терминаторы.
32. Структура лактозного оперона и механизм его регуляции с помощью белков репрессоров и активаторов.
33. Транскрипция генов эукариот с помощью РНК-полимеразы I: расположение и структура промотора, механизм его распознавания, транскрипционные факторы, последовательность сборки инициаторных комплексов на промоторе, терминация транскриптов.
34. Транскрипция генов эукариот с помощью РНК-полимеразы II: расположение и структура промотора, механизм его распознавания, транскрипционные факторы, последовательность сборки инициаторных комплексов на промоторе, терминация транскриптов.
35. Транскрипция генов эукариот с помощью РНК-полимеразы III: расположение и структура промотора, механизм его распознавания,
транскрипционные факторы, последовательность сборки инициаторных комплексов на промоторе, терминация транскриптов.
36. Энхансеры, сайленсеры и изоляторы транскрипции.
37. Характеристика ДНК-связывающих доменов факторов транскрипции эукариот (спираль-поворот-спираль, гомеодомен, спираль-петля-спираль, «лейциновая застежка», «цинковые пальцы»). Процессинг РНК
38. Модификация 5' и 3'-концов молекул мРНК эукариот. Ферменты и катализируемые ими реакции. Значение модификации концов транскриптов.
39. Процессинг пре-тРНК: формирование 5'- и 3'-концов тРНК, сплайсинг пре-тРНК эукариот, модификация оснований. Реакции и ферменты, катализирующие эти процессы.
40. Механизм сплайсинга пре-мРНК в ядре: определение границ интронов, роль аденилового (А) нуклеотида, находящегося в районе точки ветвления, реакции трансэтерификации.
41. Характеристика сплайсосомы: ее структурные компоненты, механизм функционирования. мяРНК и мяРНП-частицы. Роль комплементарных взаимодействий в протекании процесса сплайсинга.
42. Аутосплайсинг на примере рРНК тетрахимены: инициация процесса, последовательные стадии процесса, рибозим L-19РНК.
43. Примеры рибозимов и катализируемых ими реакций (L-19 РНК, РНКаза P, "головка молотка").
44. Процессинг рРНК у прокариот и эукариот (участвующие в процессе ферменты). Метилирование и другие модификации рРНК в ядрышке; роль малых РНК в этих процессах. Трансляция; преобразование белковых молекул
45. Матричная (информационная) РНК, ее структура и функциональные участки у прокариот и эукариот.
46. Основные свойства генетического кода. Особенности кодового словаря.
47. Кодон и антикодон, принципы их взаимодействия. Принцип нестрогого соответствия (wobble-гипотеза).
48. Аминоацилирование тРНК как необходимый этап трансляции: механизм действия аминоацил-тРНК-синтетаз.
49. тРНК: первичная, вторичная и третичная структура, роль модифицированных нуклеотидов.
50. Структура рибосом про- и эукариот, входящие в их состав рибосомные РНК и белки. Функциональные участки рибосом: мРНК-связывающий участок, тРНК-связывающие А, Р и Е участки, факторсвязывающий участок.
51. Механизм инициации трансляции у прокариот. Инициирующие кодоны и сайт связывания рибосом на мРНК. Инициаторная тРНК и белковые факторы инициации. Инициация трансляции внутренних рамок считывания у полицистронных мРНК.
52. Механизм инициации трансляции у эукариот. Белковые факторы, взаимодействующие с рибосомой и с мРНК. Роль кэп-структуры в инициации процесса. Влияние на инициацию трансляции структур на 3'конце мРНК. Механизм распознавания инициирующего кодона.
53. Механизм элонгации трансляции. Фактор элонгации 1 (ЕF-Тu или ЕF-1 у про- и эукариот соответственно) и поступление аминоацил-тРНК в рибосому. Реакция транспептидации: механизм и катализ. Фактор элонгации 2 (ЕF-G или ЕF-2) и транслокация рибосомы.
54. Механизм терминации трансляции у про- и эукриот. Терминирующие кодоны, белковые факторы терминации (RF1, RF2, RF3), гидролиз пептидилтРНК. Фактор RRF и диссоциация трансляционного комплекса.
55. Энергетика синтеза белка: количество макроэргических связей, необходимых на присоединение к растущему полипептиду одной аминокислоты; энергетические затраты на сборку рибосомы (при инициации трансляции) и на отсоединение готового полипептида от рибосомы.
56. Особенности синтеза белка, имеющего N-сигнальную последовательность: котрансляционная транслокация белка в полость эндоплазматического ретикулума, SRP-частица и ее рецептор.
57. Фолдинг белков: молекулярные шапероны семейств Hsp60 и Hsp70 у про- и эукариот.
58. Рабочий цикл шаперонных комплексов GroELS и DnaKJ-GrpE.
59. Деградация белков: 26S-протеасома эукариот.
60. Система убиквитинилирования белков эукариот. Сенсорные процессы
61. Сенсорные механизмы эукариот с помощью рецепторов, сопряженных с G-белками: компоненты сигнальных путей (рецепторы, G-белки, эффекторы, вторичные мессенджеры). Структура и принцип действия Gбелков.
62. Способы передачи сигнала в ядро в сигнальных путях TGFβ-Smad, JAK-STAT и Ras/MAPK. Молекулярная биология онтогенеза
63. Эмбриональное развитие D. melanogaster: асимметрия и градиенты морфогенов в ооците и раннем эмбрионе. Механизмы транспорта материнской мРНК и белков в ооцит; формирования градиентов в ооците и тканях эмбриона.
64. Роль морфогенов в формировании переднего и заднего концов эмбриона D. melanogaster.
65. Принципы контроля сегментации и дифференциации сегментов у эмбриона D. melanogaster.
66. Характеристика гомеозисных генов комплексов Antennapedia и Bithorax дрозофилы и их продуктов; принципы их действия; фенотипическое проявление мутаций данных генов. Гомеобокс и гомеодомен.
67. Hox-кластеры гомеозисных генов у различных организмов, принципы их действия. Организация геномов
68. Семейства гомологичных генов. Ортологи и паралоги.
69. Псевдогены.
70. Типы повторяющихся последовательностей и их встречаемость в геномах различных организмов.

B-форма ДНК (B form of DNA) — одно из трех основных конформационных состояний двухцепочечной ДНК (А, В- и Z-ДНК), в которой 2 нити спирали образуют правозакрученную спиральную структуру с диаметром 20 ангстрем. В-ДНК наиболее часто встречается in vivo и характеризуется наличием большой и малой бороздок; в В-ДНК число пар оснований на 1 виток равно 10,5, а расстояние между парами оснований — 0,34 нм.
В-ДНК и родственные ей C-ДНК , D-ДНК и T-ДНК принадлежат В-семейству двойных спиралей. В B-форме, как и в А-форме, спираль ДНК, как говорилось выше,  является правой. У этого семейства фуранозные кольца имеют конформацию С2'-эндо (или близкую ей С3'-экзо), расстояние между соседними фосфатами увеличивается до 7 А, а угол, описывающий вращение вокруг гликозидной связи С1'-N, оказывается в диапазоне приблизительно в 90-120 град.
В В-форме ДНК на виток спирали приходится около 10 пар оснований и расстояние между нуклеотидами вдоль оси спирали составляет от 3,3 до 3,4 А, поэтому у оснований наблюдается лишь небольшой отрицательный наклон приблизительно в 6 град. Эти характеристики и определяют макроскопическую структуру В-ДНК, представленную на Рис. B-ДНК .
Пары оснований расположены на оси спирали (смещение от оси около -0,2 А). Так как ось спирали проходит через пары, поэтому в В-ДНК желобки менее выражены, чем в A-ДНК . Их глубина примерно одинакова, но ширина различается (см. ниже Таблицу): минорный желобок узкий, а главный желобок - широкий и открытый.
Двойная спираль Уотсона и Крика — это структура B-формы ДНК. Вскоре после их работы с помощью рентгеноструктурного анализа, с помощью рассеяния рентгеновских лучей была определена структура и A-формы ДНК.
Вскоре выяснилось, что A-форма ДНК тоже имеет огромное биологическое значение. Оказалось, что двойная спираль, которая создает молекулы РНК, и в растворе, при обычной высокой влажности находится в A-форме, а не в B-форме. Это связано с тем, что РНК отличается от ДНК тем, что сахар, химический элемент структуры ДНК и РНК — это нуклеотид. Нуклеотид состоит из фосфата, сахара и азотистого основания. В том и в другом случае сахар немножко разный: у ДНК он имеет в определенном положении просто водород, а у РНК — гидроксильную группу OH. Поэтому РНК называется рибонуклеиновая кислота, отсюда сокращение РНК.

Собственная разработка

Не нашeл, что искал?
Закажи оригинальную работу сейчас
Узнать стоимость
Оставить отзыв
Имя
Город
Рейтинг
Отзыв

Задать вопрос
Задать вопрос